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| Registros recuperados : 30 | |
| 1. |  | SOUZA, L. F. da S.; SOUZA, R. F.; JESUS, A. F. de; ALMEIDA, E. M. de; REZENDE, J. de O.; SANTOS, Z. G. dos; CALAZANS, J. A. Adubacao da cana-de-acucar em solo de tabuleiro do Estado de Sergipe. Cruz das Almas, BA: IPEAL, 1971. 6p. (IPEAL. Pesquisas e Experimentos. Comunicado Tecnico, 28).| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 8. | | RODRIGUES, B. L. S.; ALMEIDA, E. M. de; ALMEIDA, R. G. de; MIYAGI, E. S.; GARCIA, E. da C.; RIBEIRO, F. M. Características estruturais e massa de forragem de Capim-Piatã em sub-bosque de eucalipto. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 55.; CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 28., 2018, Goiânia. Construindo saberes, formando pessoas e transformando a produção animal: anais. Viçosa: Sociedade Brasileira de Zootecnia; Brasília, DF: Associação Brasileira de Zootecnistas.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 9. | | MOREIRA, G. M.; ALMEIDA, R. G. de; ABREU, J. G. de; RODRIGUES, J. A.; ALMEIDA, E. M. de; HERRERA, D. M.; CABRAL, C. E. A.; DOERZBACHER, A. L. S.; ASSIS, L. M. B.; BARBOSA JUNIOR, J. B. Características fitométricas de sorgo consorciado com capim-piatã em sub-bosque de eucalipto. In:In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SISTEMAS INTEGRADOS DE PRODUÇÃO AGROPECUÁRIA, 2.; ENCONTRO DE INTEGRAÇÃO LAVOURA-PECUÁRIA DO SUL DE MATO GROSSO, 2., Rondonópolis, 2018. Anais eletrônicos... Mato Grosso: UFMT, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 11. | | SILVA, L. B. X. da; MELO, T. S.; CONCENÇO, G.; PARFITT, J. M. B.; VIEIRA, P. A.; ALMEIDA, E. M. de; BARCELOS, A. V.; DEUNER, S. Deficiência hídrica altera o desempenho fisiológico em plantas de arroz irrigado em estádio reprodutivo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 11., 2019. Balneário Camboriú. Inovação e desenvolvimento na orizicultura: anais eletrônico. Itajaí: Epagri/Sosbai, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 12. | | TELES, V. S.; ALMEIDA, E. M. de; COSTA, G. F.; ALMEIDA, R. G. de; GOMES, R. da C.; MIYAGY, E. S. Desempenho de novilhos Nelore em sistemas silvipastoris. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 13., 2017, Campo Grande, MS. [Anais...] Brasília, DF: Embrapa, 2017. p. 106. (Embrapa Gado de Corte, Documentos, 242)| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 14. | | ALMEIDA, E. M. de; GOMES, R. da C.; LAURA, V. A.; ALMEIDA, R. G. de. Emissão e sequestro de carbono em sistemas silvipastoris na fase de recria . In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 14., 2018, Campo Grande - MS. [Resumos dos trabalhos]. Brasília, DF, Embrapa, 2018 115 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 258). p. 42-43| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 17. | | ALMEIDA, E. M. de; MONTAGNER, D. B.; ARAUJO, A. R. de; MACEDO, M. C. M.; FERREIRA, D. P.; DIFANTE, G. dos S.; PEDROSO FILHO, N. D. Massa de raízes de cultivares de Panicum maximum submetidas a doses de fósforo e nitrogênio em Neossolo Quartzarênico. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE SOLOS ARENOSOS, 3., 2019, Campo Grande, MS. Anais... Editores técnicos: Wenceslau Geraldes Teixeira, Guilherme Kangussu Donagemma. Brasília, DF : Embrapa, 2019. Título em inglês: Root mass of Panicum maximum cultivars submitted to Phosphorus and nitrogen doses in sandy soils.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 18. | | ALMEIDA, E. M. de; MONTAGNER, D. B.; ARAUJO, A. R. de; MACEDO, M. C. M.; FERREIRA, D. P.; DIFANTE, G. dos S.; SCARIOT, C. Massa de raízes de forrageiras submetidas a doses de fósforo e nitrogênio em Neossolo Quartzarênico Órtigo da Região de Campo Grande - MS. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE SOLOS ARENOSOS, 3., 2019, Campo Grande, MS. Anais... Editores técnicos: Wenceslau Geraldes Teixeira, Guilherme Kangussu Donagemma. Brasília, DF : Embrapa, 2019. Título em inglês: Roots mass for forage submitted to Phosphorus ad nitrogen doses in typic Quartzipsamments Soil on Campo Grande - MS Region.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| Registros recuperados : 30 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
26/03/2019 |
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Data da última atualização: |
21/06/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOUZA SOBRINHO, F. de; FRAGOSO, R. da R.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FERREIRA, M. E. |
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Afiliação: |
MARCO AURELIO CALDAS DE PINHO PESSO, CPAC; FAUSTO DE SOUZA SOBRINHO, CNPGL; RODRIGO DA ROCHA FRAGOSO, CPAC; ORZENIL BONFIM DA SILVA JUNIOR, Cenargen; MARCIO ELIAS FERREIRA, Cenargen. |
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Título: |
A phased diploid genome assembly for the forage grass urochloa ruziziensis based on single-molecule real-time sequencing. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 27., 2019, San Diego. Proceedings... Livingston, NJ: Scherago, 2019 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Plant and Animal Genome XXVII Conference (PAG). |
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Conteúdo: |
Ruzigrass (Urochloa ruziziensis) is a diploid, tropical forage grass native to Africa, widely planted in Brazil, known for its high nutritional quality. It is closely related to important forage species of Urochloa, and plays a crucial role in the breeding program of brachiaria grasses, mostly focused on inter-specific hybirds. Previous studies from our group based on shallow Illumina sequencing resulted in the development of the first molecular markers for the species (Silva et al., 2013), as well as in assessments of germplasm diversity and structure (Pessoa-Filho et al., 2015). Assembly and analysis of complete plastid genomes for four Urochloa species allowed the characterization of their phylogenetic divergence (Pessoa-Filho et al., 2017). Here, we present a near-complete phased diploid genome assembly of the heterozygous ruzigrass clone C69. We used PacBio Sequel to generate over 13.3 million long reads (mean size 6.5 kbp), adding up to 87.5 Gbp of raw data (~142x coverage). The current diploid assembly using FALCON-Unzip contains ~603 Mbp in 3,539 primary contigs, with NG50 of 286 kbp, and covers 98.2% of the estimated haploid genome size of 615 Mbp for ruzigrass. In addition, 82% of the assembly could be phased as separate haplotypes, with ~500 Mbp resolved as haplotigs. Assessment of assembly completeness showed 95.2% BUSCO matches as complete, and 83.3% as complete single-copy. Ongoing research includes transcriptome assembly to aid gene prediction and annotation, anchoring of contigs in linkage maps, and Hi-C scaffolding. A high-quality, chromosome-scale genome assembly for ruzigrass will aid research groups in the development and application of genomic tools in breeding and genetics of brachiaria grasses. MenosRuzigrass (Urochloa ruziziensis) is a diploid, tropical forage grass native to Africa, widely planted in Brazil, known for its high nutritional quality. It is closely related to important forage species of Urochloa, and plays a crucial role in the breeding program of brachiaria grasses, mostly focused on inter-specific hybirds. Previous studies from our group based on shallow Illumina sequencing resulted in the development of the first molecular markers for the species (Silva et al., 2013), as well as in assessments of germplasm diversity and structure (Pessoa-Filho et al., 2015). Assembly and analysis of complete plastid genomes for four Urochloa species allowed the characterization of their phylogenetic divergence (Pessoa-Filho et al., 2017). Here, we present a near-complete phased diploid genome assembly of the heterozygous ruzigrass clone C69. We used PacBio Sequel to generate over 13.3 million long reads (mean size 6.5 kbp), adding up to 87.5 Gbp of raw data (~142x coverage). The current diploid assembly using FALCON-Unzip contains ~603 Mbp in 3,539 primary contigs, with NG50 of 286 kbp, and covers 98.2% of the estimated haploid genome size of 615 Mbp for ruzigrass. In addition, 82% of the assembly could be phased as separate haplotypes, with ~500 Mbp resolved as haplotigs. Assessment of assembly completeness showed 95.2% BUSCO matches as complete, and 83.3% as complete single-copy. Ongoing research includes transcriptome assembly to aid gene prediction and annotation, ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Brasil. |
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Thesagro: |
Capim Urochloa; Genoma. |
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Categoria do assunto: |
K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/194810/1/abstract-PAG-XXVII.pdf
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Marc: |
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260 $aIn: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 27., 2019, San Diego. Proceedings... Livingston, NJ: Scherago$c2019
500 $aPlant and Animal Genome XXVII Conference (PAG).
520 $aRuzigrass (Urochloa ruziziensis) is a diploid, tropical forage grass native to Africa, widely planted in Brazil, known for its high nutritional quality. It is closely related to important forage species of Urochloa, and plays a crucial role in the breeding program of brachiaria grasses, mostly focused on inter-specific hybirds. Previous studies from our group based on shallow Illumina sequencing resulted in the development of the first molecular markers for the species (Silva et al., 2013), as well as in assessments of germplasm diversity and structure (Pessoa-Filho et al., 2015). Assembly and analysis of complete plastid genomes for four Urochloa species allowed the characterization of their phylogenetic divergence (Pessoa-Filho et al., 2017). Here, we present a near-complete phased diploid genome assembly of the heterozygous ruzigrass clone C69. We used PacBio Sequel to generate over 13.3 million long reads (mean size 6.5 kbp), adding up to 87.5 Gbp of raw data (~142x coverage). The current diploid assembly using FALCON-Unzip contains ~603 Mbp in 3,539 primary contigs, with NG50 of 286 kbp, and covers 98.2% of the estimated haploid genome size of 615 Mbp for ruzigrass. In addition, 82% of the assembly could be phased as separate haplotypes, with ~500 Mbp resolved as haplotigs. Assessment of assembly completeness showed 95.2% BUSCO matches as complete, and 83.3% as complete single-copy. Ongoing research includes transcriptome assembly to aid gene prediction and annotation, anchoring of contigs in linkage maps, and Hi-C scaffolding. A high-quality, chromosome-scale genome assembly for ruzigrass will aid research groups in the development and application of genomic tools in breeding and genetics of brachiaria grasses.
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650 $aGenoma
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700 1 $aFRAGOSO, R. da R.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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